Thomas Popper Jr. (Carrey) is een gehaaide New Yorkse projectontwikkelaar die op het punt staat partner te worden binnen het bedrijf waar hij werkt. Nog één klus moet hij zien te klaren, voordat zijn naam op de gevel van de zaak prijkt. Die klus is echter wel lastig: hij moet de oude maar ervaren - en taaie! - Mrs. Van Gundy (Angela Lansbury) ervan zien te overtuigen haar legendarische restaurant Tavern on the Green in Central Park te verkopen. Maar dan komt Poppers globetrottende vader te overlijden en erft hij... een pinguïn. Omdat geen enkele instantie het dier van hem over wil nemen, is hij gedwongen het beest tijdelijk is zijn smetteloze yuppenappartement op te sluiten. Een dag later vindt Popper ineens een kist met nóg vijf pinguins voor zijn deur. Hij zit met zijn handen in het haar, tot hij ontdekt dat zijn twee kinderen (Madeline Carroll en Maxwell Perry Cotton), van wie hij vervreemd is, dol op de dieren zijn. Zelfs zijn ex-vrouw Amanda (Carla Gugino) lijkt te ontdooien. Dankzij de pinguïns leert Popper wat écht belangrijk is in het leven.

Een rol zoals die in 'Mr. Popper's Penguins' is Jim Carrey op het lijf geschreven. Ogenschijnlijk zonder enige moeite trekt de komiek de film naar zich toe, al speelt hij voor zijn doen nogal ingetogen en laat hij de meeste gekke fratsen aan de pinguïns over. De voorspelbaarheid en het weinig realistische verloop en een mierzoet einde, zoals we dat ook vaak zien in live-action producties uit de stal van Disney, verklappen dat deze film gemaakt is voor een jeugdige doelgroep. Voor volwassenen valt er slechts sporadisch iets te lachen, zeker in de nagesynchroniseerde versie die in de meeste Nederlandse zalen te zien is, aangezien woordgrappen in de oorspronkelijke taal toch vaak scherper zijn dan wanneer ze vertaald worden. Meest concrete voorbeeld is het allitererende spraakgebrek van Poppers assistente, dat in het Nederlands compleet doodvalt. Maar een vervelende zit is 'Mr. Popper's Penguins' zeker niet. Jim Carrey is zoals gezegd op dreef en ook de andere acteurs doen het heel aardig. De show wordt uiteraard gestolen door de pinguïns. Naast echte, getrainde dieren werd ook gebruikt gemaakt van CGI, maar dit is vakkundig gedaan zodat je nauwelijks verschil ziet.